近年來應用磁化水除垢裝置已逐步推廣。鐵路部門已廣泛應用于鍋爐設備的除垢，但它也可用于冷凝器的除垢。方法是在冷卻水進入冷凝器前，流過一個磁水器，如圖5-8所示的是磁水器的結構圖。水流經過橫向磁場后，使成垢的陰、陽離子發生變形，破壞或削弱離子間的相互作用，改變了結晶條件，使構成硬質水垢的碳酸鈣的結晶態變成帶磁場的粉末物質。這種物質很酥松，很脆、粘固性與附著力極弱，它們呈松渣狀沉落下米，被排除出冷凝器，即使還有一部分雜質殘留或進入冷凝器管壁，也很難附結在設備表面。此種方法不僅能有效地防止在冷卻系統的設備表面結垢，而且還能使冷凝器內原有的水垢逐漸疏松，自行脫落，因此，它很適合于冷凝器的除垢。

磁化水除垢的流程，見圖5-9。水泵將水箱里冷卻水抽出，經磁水器(一般應垂直安裝)處理后進入冷凝器，再返回水箱，為不使氧化鐵屑或淤渣沉積在冷卻管內，在磁水器的進水端最好裝只過濾器。據有關資料介紹，磁化水經6-7天的循環流動，管內的硬垢即變為軟的粉末，它從管壁脫落并隨即被循環水帶走。

磁化水除垢的方法，具有操作方便，勞動強度低，安全、無毒，又不易損傷冷凝器的管壁，流程的設備也不太復雜等優點，是除垢的好途徑。