安全保護系統是制冷裝置自動控制的必要部分，它和自動調節控制系統是制冷裝置自動化中兩個相輔相成的基本組成部分。活塞式制冷裝置常用的安全保護系統主要有以下幾種。

排氣壓力(即高壓)保護的目的是防止因冷凝器斷水或水雖供應嚴重不足，或者由于啟動時排氣管路的閥門未打開，或者制冷劑灌注過多，或者因系統中不凝性氣體過多等原因造成排氣壓力急劇上升而產生事故。為此使用壓力控制器來控制排氣壓力，一旦排氣壓力超過給定值，控制器立即切斷壓縮機電機的電源，使壓縮機停機。

若制冷裝置運行的吸氣壓力(即低壓)過低，若在庫溫已達到要求的情況下壓縮機繼續運行，勢必會使吸氣壓力越來越低，這樣就會產生兩種不良后果，一是由于吸氣壓力很低，則蒸發溫度很低，就會使儲存食品的干耗增大，并易引起食品變質;二是如果裝置低壓側有泄漏的話，則會導致大量空氣滲入系統內，從而造成壓縮機排氣壓力和排氣溫度升高，功耗增大，產冷量降低，有時在膨脹閥處還會產生“冰塞”現象。因此壓縮機的吸氣壓力也必須加以控制，使它保持在一定值以上工作。控制吸氣壓力除了起保護作用外，在小型制冷裝置上還可直接用控制吸氣壓力的辦法來控制壓縮機的停車和開車，實現庫溫控制。