電子水垢處理儀是近年來被廣泛應用于冷卻水系統中對水質進行處理的高科技產品，它的基本工作原理如下：
1)電子水垢處理儀是通過對流經處理儀的水施加高頻電磁場，使其物理結構和物理性質發生變化，來實現防垢、除垢、殺菌、滅藻、防腐等功能。
2)水在高頻電磁場的作用下，原來締合成鏈狀的大分子斷裂成單個水分子，使其活性大大增強，溶解在水中的鹽類的正、負離子被單個水分子包圍，運動速度降低，有效碰撞次數減少，在管壁上無法成垢，從而達到防垢的目的。
3)對于已經在管壁上形成的老的垢層，其主要成分是垢分子(CaCO? 、CaSO?等)，通過分子間的作用力結合在一起，以網狀結構附著在管道內壁上。而通過高頻電磁場作用后，水分子的偶極距增大，極性增強，水分子處于較高的能量狀態。它能有效消弱垢分子間的作用力及其與管壁的附著力，使垢層逐漸軟化、龜裂，在水流的沖刷下從管壁上脫落，起到除垢作用。
高頻電磁場除可破壞垢層結構外，還可在水體中激發出大量的自由電子，能有效防止管道內壁的金屬原子失去電子被氧化，并能有效地破壞引起管道腐蝕的微電池效應，從而起到防止管道氧化和腐蝕的作用。
另外，電子水垢處理儀的高頻電場還能使水中產生一定量的活性氧，如超氧陰離子自由基(O?)ˉ過氧化氫H?O?，羥基自由基OHˉ及臭氧O?，這些物質對水中的細菌、藻類有極強的破壞能力，因此電子水處理儀還具有顯著的殺菌、滅藻的功效。
