一直被廣泛應用的氟利昂，在20世紀70年代被發現是破壞大氣臭氧層的主要因素。以CFCs物質為例，分子結構很穩定，也不可燃，在大氣中存在時間很長。一旦因使用或檢修而排放出制冷系統，會在大氣中長時間擴散，到達平流層后，在陽光照射下分解出抓原子。一個抓原子可以和約十萬個臭氧分子發生連鎖反應，從而減少平流層中臭氧的濃度。例如R12(CFC12)破壞奧氧層時與O3反應的方程式如下。

而大氣臭氧層是地球生物免遭有害射線輻射的保護傘，它的衰減甚至出現空洞會使人類及生物遭受過量紫外線的傷害，由此引發了人們對由于人造化合物中的氯和溴元素而引起的臭氧層變薄的嚴重關注。除R717、水等天然物質外，不少制冷劑都不同程度地會使氣候變暖的趨勢加速，助長地球的溫室效應。

地球大氣中的輻射、反射、發射與吸收等本來保持著平衡關系，由于人類的活動，大量溫室氣體排人大氣，直接改變了大氣的熱量傳遞平衡關系，使大氣變成類似于塑料大棚。陽光可以方便地透射到地面，向地面放出熱量，但地面接收的熱量很難再穿透大氣進入太空，形成了氣候不斷變暖的不利趨勢，這即是所謂的溫室效應。高山雪線的上移、兩極冰川的不正常加速融化都是這一現象的明證。

制冷設備安裝、運行或檢修等過程中釋放出的制冷劑，加之生活、生產中大量排放的C02，一定時間內在大氣中存在并擴散，它們彌漫在大氣中，如同在地球上方支起了一座龐大無比的暖棚，對全球變暖起到了直接的影響。倘若任其繼續發展下去，兩極的冰川就會全部融化，海平面將隨之升高60m，世界的許多地區將被海水淹沒。